54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3608 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 1008 aa  2038    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1203 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1080 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1101 aa  288  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1119 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  34.47 
 
 		 656 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  33.14 
 
 		 651 aa  204  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  30.82 
 
 		 649 aa  198  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  32.64 
 
 		 647 aa  197  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  33.87 
 
 		 650 aa  193  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  31.16 
 
 		 737 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  31.69 
 
 		 644 aa  191  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  30.05 
 
 		 650 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  32.34 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  33.26 
 
 		 653 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  32.59 
 
 		 676 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  33.87 
 
 		 652 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  31.54 
 
 		 676 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  29.37 
 
 		 647 aa  174  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.33 
 
 		 677 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  29.08 
 
 		 692 aa  164  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  35.47 
 
 		 785 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  28.3 
 
 		 649 aa  140  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  33.17 
 
 		 796 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  52.59 
 
 		 843 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  31.73 
 
 		 730 aa  118  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  27.95 
 
 		 760 aa  110  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  29.18 
 
 		 957 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  43.57 
 
 		 289 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  36.9 
 
 		 854 aa  105  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  26.64 
 
 		 469 aa  95.9  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.32 
 
 		 469 aa  94  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  25.99 
 
 		 469 aa  91.3  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1088 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1744 aa  89  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  26.24 
 
 		 833 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  32.46 
 
 		 986 aa  85.1  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1183 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  39.55 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  25.53 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  28.74 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  38.06 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1168 aa  70.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1030 aa  65.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1022 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1332 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1236 aa  55.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1258 aa  54.7  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1235 aa  52  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  25 
 
 		 939 aa  51.2  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  23.44 
 
 		 1007 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1124 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1289 aa  45.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  25.15 
 
 		 347 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>