55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4392 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  53.37 
 
 		 647 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  52.05 
 
 		 647 aa  666    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1314    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  54.67 
 
 		 644 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  57.81 
 
 		 650 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  48.86 
 
 		 652 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  45.84 
 
 		 706 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  44.19 
 
 		 650 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  42.35 
 
 		 676 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  41.4 
 
 		 649 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  43.16 
 
 		 653 aa  475  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  41.87 
 
 		 676 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  34.93 
 
 		 737 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  33.29 
 
 		 785 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.12 
 
 		 677 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.63 
 
 		 692 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  31.76 
 
 		 651 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1008 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1203 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1119 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.96 
 
 		 649 aa  170  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  29.36 
 
 		 730 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  28.75 
 
 		 760 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  34.59 
 
 		 796 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  31.22 
 
 		 854 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1101 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1080 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  46.79 
 
 		 843 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  45.95 
 
 		 289 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  26.38 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  31.43 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  30.95 
 
 		 503 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  25.48 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.38 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.23 
 
 		 469 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1168 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1235 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1744 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1236 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1124 aa  53.9  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1332 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  27.94 
 
 		 814 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1030 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  25.39 
 
 		 833 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  37.76 
 
 		 833 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  31.31 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  42.86 
 
 		 863 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  30 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  24.29 
 
 		 1007 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  30.08 
 
 		 986 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1258 aa  44.3  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  28.26 
 
 		 369 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>