42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1725 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  51.46 
 
 
737 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  100 
 
 
785 aa  1607    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  34.97 
 
 
676 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  35.15 
 
 
676 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  33.29 
 
 
656 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  32.83 
 
 
650 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  32.42 
 
 
652 aa  333  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  31.19 
 
 
706 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  31.71 
 
 
647 aa  330  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  32.43 
 
 
649 aa  327  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  35.39 
 
 
647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  32.07 
 
 
653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  36.21 
 
 
644 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  35.08 
 
 
650 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  27.47 
 
 
651 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  35.47 
 
 
1008 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  26.47 
 
 
1203 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  25.83 
 
 
677 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  24.91 
 
 
649 aa  127  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  23.87 
 
 
1119 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  39.86 
 
 
796 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  24.32 
 
 
692 aa  111  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  47.66 
 
 
843 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  37.5 
 
 
854 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  46.36 
 
 
760 aa  94  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  23.12 
 
 
1101 aa  88.2  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  51.32 
 
 
289 aa  87.8  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  44 
 
 
730 aa  83.2  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  31.01 
 
 
1080 aa  79  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  25.47 
 
 
1183 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  36.47 
 
 
503 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.16 
 
 
469 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.16 
 
 
469 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  36.47 
 
 
503 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  34.88 
 
 
833 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  27.18 
 
 
469 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  31.76 
 
 
833 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  22.58 
 
 
1235 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  33.71 
 
 
814 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  22.45 
 
 
1236 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  24.42 
 
 
423 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  22.4 
 
 
1252 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>