41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0666 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  996    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  96.42 
 
 
503 aa  949    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  33.6 
 
 
469 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  33.87 
 
 
469 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  33.67 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.44 
 
 
1119 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  31.3 
 
 
1101 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  33.03 
 
 
651 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  27.59 
 
 
854 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  24.36 
 
 
1203 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  30.45 
 
 
677 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  29.29 
 
 
1183 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  38.06 
 
 
1008 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  31.85 
 
 
1030 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  33.97 
 
 
1168 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  31.25 
 
 
814 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  33.11 
 
 
957 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  34.07 
 
 
833 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  30.95 
 
 
656 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  29.15 
 
 
986 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  31.92 
 
 
706 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  33.78 
 
 
1744 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  30.82 
 
 
833 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  33.66 
 
 
650 aa  64.3  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  31.58 
 
 
676 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  36.92 
 
 
730 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  30.48 
 
 
647 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  28.85 
 
 
676 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  34.16 
 
 
649 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  27.01 
 
 
1088 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  28.41 
 
 
843 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  25.21 
 
 
1080 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  36 
 
 
737 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  30.13 
 
 
647 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  33.61 
 
 
773 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  36.47 
 
 
785 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  27.03 
 
 
644 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  29.94 
 
 
650 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  28.57 
 
 
760 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  25.53 
 
 
649 aa  47  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  37.38 
 
 
652 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>