57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1950 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1305    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  34.6 
 
 
677 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  33.09 
 
 
656 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  34.75 
 
 
650 aa  266  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  33.58 
 
 
644 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  35.01 
 
 
647 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  33.19 
 
 
649 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  31.76 
 
 
676 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  30.63 
 
 
647 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  31.24 
 
 
676 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  32.2 
 
 
650 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.33 
 
 
692 aa  237  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  33.08 
 
 
1008 aa  230  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  32.26 
 
 
653 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  30.56 
 
 
649 aa  225  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  29.59 
 
 
652 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  27.44 
 
 
737 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  39.79 
 
 
796 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  31.33 
 
 
730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  30.69 
 
 
760 aa  191  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  29.3 
 
 
1203 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  25.34 
 
 
785 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.74 
 
 
1080 aa  170  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.94 
 
 
1119 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  31.93 
 
 
706 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  28.92 
 
 
1101 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  28.1 
 
 
854 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  30.31 
 
 
503 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  30.68 
 
 
957 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  31.16 
 
 
503 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.12 
 
 
1744 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  34 
 
 
833 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  41.59 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  27.85 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  30.18 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.98 
 
 
1183 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  27.22 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.9 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  23.72 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  34.36 
 
 
986 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  29.41 
 
 
1088 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  27.97 
 
 
1236 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  26.34 
 
 
1022 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  34.75 
 
 
1168 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  27.68 
 
 
1332 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  28.57 
 
 
814 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  28.5 
 
 
346 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.38 
 
 
1289 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  27.74 
 
 
939 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  26.11 
 
 
1258 aa  51.6  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  24.1 
 
 
1252 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  28.79 
 
 
792 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  27.33 
 
 
347 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  23.81 
 
 
1124 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  25.16 
 
 
1030 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  26.85 
 
 
347 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  28.71 
 
 
376 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>