32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1513 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  594  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  60.53 
 
 
1008 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  58.11 
 
 
653 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  56.76 
 
 
650 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  52.7 
 
 
649 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  47.13 
 
 
676 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  45.98 
 
 
676 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  47.83 
 
 
796 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  51.35 
 
 
692 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  50.65 
 
 
706 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  52.63 
 
 
737 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  51.32 
 
 
785 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  46.75 
 
 
647 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  50.67 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  41.41 
 
 
649 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  49.35 
 
 
843 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  48.05 
 
 
644 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  45.95 
 
 
656 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  51.39 
 
 
677 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  46.67 
 
 
652 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  45.45 
 
 
854 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  41.46 
 
 
647 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  46.15 
 
 
760 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  26.87 
 
 
1119 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  24.02 
 
 
1203 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  39.44 
 
 
730 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  22.28 
 
 
1080 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  40.23 
 
 
651 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  24.87 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  24.24 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  24.24 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  24.51 
 
 
1101 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>