52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5381 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  59.6 
 
 		 647 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  53.72 
 
 		 647 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  54.67 
 
 		 656 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1266    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  57.23 
 
 		 650 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  48.24 
 
 		 652 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  47.37 
 
 		 706 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  46.17 
 
 		 650 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  44.55 
 
 		 649 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  44.1 
 
 		 676 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  43.93 
 
 		 676 aa  482  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  43.84 
 
 		 653 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  37.08 
 
 		 737 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  36.21 
 
 		 785 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  32.39 
 
 		 651 aa  233  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  30.72 
 
 		 677 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.45 
 
 		 692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1008 aa  190  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1203 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  28 
 
 		 649 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1119 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  29.06 
 
 		 730 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  46.76 
 
 		 796 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1080 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  50 
 
 		 843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  31.13 
 
 		 854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1101 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  36.77 
 
 		 760 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  29 
 
 		 469 aa  87.4  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.48 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.18 
 
 		 469 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  48.05 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1235 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  25.54 
 
 		 1007 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1236 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1744 aa  60.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  25 
 
 		 1332 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  24.76 
 
 		 957 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  28.1 
 
 		 986 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1258 aa  54.7  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1088 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1413 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  27.43 
 
 		 814 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  32.61 
 
 		 503 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  25.87 
 
 		 833 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  25 
 
 		 833 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1252 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  38.36 
 
 		 2204 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  41.38 
 
 		 863 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1246 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>