41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0849 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  100 
 
 
957 aa  1938    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  35.33 
 
 
833 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  38.12 
 
 
1030 aa  233  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  31.22 
 
 
1088 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  33.6 
 
 
1744 aa  152  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  32.17 
 
 
986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  30.6 
 
 
939 aa  125  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.61 
 
 
1008 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  24.7 
 
 
1203 aa  104  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  33.18 
 
 
651 aa  92.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  32.85 
 
 
792 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.96 
 
 
833 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  29.15 
 
 
1168 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  30.26 
 
 
1183 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  26.26 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.26 
 
 
469 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  27.72 
 
 
676 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.26 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  31.16 
 
 
1101 aa  73.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  29.84 
 
 
676 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  26.99 
 
 
1119 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  31.97 
 
 
1080 aa  71.2  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  34.29 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.11 
 
 
503 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  25.48 
 
 
656 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  27.85 
 
 
677 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  30.99 
 
 
650 aa  62  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  25.19 
 
 
854 aa  61.6  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  25.35 
 
 
647 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  29.74 
 
 
649 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  24.52 
 
 
730 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  26.64 
 
 
652 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  24.76 
 
 
644 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  24.31 
 
 
647 aa  56.2  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  29.11 
 
 
653 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  23.91 
 
 
649 aa  54.7  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  39.78 
 
 
814 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  25.1 
 
 
737 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  29.08 
 
 
796 aa  51.2  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  26.04 
 
 
843 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  26.79 
 
 
692 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>