54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3825 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1397    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  45.98 
 
 		 656 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  47.51 
 
 		 644 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  47.45 
 
 		 650 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  44.94 
 
 		 647 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  46.85 
 
 		 647 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  42.92 
 
 		 652 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  42.11 
 
 		 650 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  39.45 
 
 		 676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  38.48 
 
 		 676 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  40.2 
 
 		 653 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  35.14 
 
 		 737 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  31.19 
 
 		 785 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  43.12 
 
 		 649 aa  251  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  25.39 
 
 		 692 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1008 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.88 
 
 		 649 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1119 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1080 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  35.08 
 
 		 677 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1203 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  37.13 
 
 		 651 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1101 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  45.19 
 
 		 854 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  33.22 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  40.66 
 
 		 796 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  50.46 
 
 		 843 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  50.65 
 
 		 289 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  37.12 
 
 		 760 aa  87.4  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.42 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.07 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.07 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  33.01 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1168 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  31.43 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  29.55 
 
 		 503 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1183 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1246 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.36 
 
 		 833 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1124 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1088 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  26.64 
 
 		 833 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1332 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1413 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  28.31 
 
 		 986 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  27.51 
 
 		 773 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1258 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1236 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1744 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0201  hypothetical protein  29.9 
 
 		 305 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  28.35 
 
 		 393 aa  44.3  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1235 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  28.08 
 
 		 374 aa  43.9  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>