51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2269 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  100 
 
 
647 aa  1260    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  54.4 
 
 
647 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  53.37 
 
 
656 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  59.6 
 
 
644 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  57.12 
 
 
650 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  48.31 
 
 
652 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  46.7 
 
 
706 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  44.75 
 
 
649 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  42.98 
 
 
676 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  42.94 
 
 
676 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  43.93 
 
 
650 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  43.29 
 
 
653 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  33.06 
 
 
737 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  31.71 
 
 
785 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  33.33 
 
 
677 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  34.81 
 
 
651 aa  227  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  32.64 
 
 
1008 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  27.14 
 
 
692 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  27.94 
 
 
1203 aa  170  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  29.87 
 
 
730 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.84 
 
 
649 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.35 
 
 
1119 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  33.24 
 
 
854 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.54 
 
 
1101 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  47.62 
 
 
843 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  25.98 
 
 
1080 aa  120  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  43.55 
 
 
796 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  27.74 
 
 
760 aa  84.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  41.46 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  25.23 
 
 
1022 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  36.02 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.82 
 
 
1744 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  30.48 
 
 
503 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  25.35 
 
 
957 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  32.24 
 
 
1183 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  27.73 
 
 
833 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  25.77 
 
 
469 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.75 
 
 
1235 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  30.77 
 
 
1168 aa  57.4  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  24.67 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  24.42 
 
 
469 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  27.11 
 
 
1236 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  25.31 
 
 
1332 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  31.79 
 
 
374 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  29.18 
 
 
814 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.38 
 
 
833 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  21.47 
 
 
1252 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  44.23 
 
 
863 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  28.93 
 
 
1289 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  30.9 
 
 
1088 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  22.6 
 
 
1258 aa  43.9  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>