44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1864 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  100 
 
 
692 aa  1423    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.55 
 
 
677 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.9 
 
 
649 aa  241  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  28.63 
 
 
656 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  30.28 
 
 
650 aa  228  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  29.73 
 
 
649 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  29.13 
 
 
653 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  28.22 
 
 
647 aa  211  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  28.06 
 
 
644 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  29.25 
 
 
652 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  27.88 
 
 
676 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.45 
 
 
676 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  28.95 
 
 
650 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  28.37 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  26.34 
 
 
760 aa  184  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  25.13 
 
 
706 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  27.14 
 
 
647 aa  167  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.41 
 
 
1008 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  25.14 
 
 
730 aa  153  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.92 
 
 
1203 aa  152  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  30.69 
 
 
796 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  26.92 
 
 
1119 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  30.07 
 
 
1080 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  27.85 
 
 
1101 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  24.32 
 
 
785 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  27.51 
 
 
469 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  27.18 
 
 
469 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.62 
 
 
469 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  24.7 
 
 
737 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  51.35 
 
 
289 aa  92  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  38.18 
 
 
843 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  37.08 
 
 
854 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  23.65 
 
 
1183 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  27.09 
 
 
1168 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  24.64 
 
 
833 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  27.98 
 
 
1236 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  27.71 
 
 
1022 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  28.37 
 
 
1235 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  21.74 
 
 
1252 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.73 
 
 
1124 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  24.84 
 
 
1258 aa  52.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.79 
 
 
957 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  20.75 
 
 
1332 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  25.12 
 
 
1088 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>