30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1045 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  40.51 
 
 		 1007 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 1022 aa  2103    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1124 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1235 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1236 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1258 aa  365  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1332 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1252 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1246 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1413 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1289 aa  232  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1358 aa  228  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1286 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  27.6 
 
 		 760 aa  76.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  25.23 
 
 		 647 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  27.71 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  22.98 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  21.2 
 
 		 676 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  23.26 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1203 aa  57.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  24.17 
 
 		 653 aa  57.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1008 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  24.66 
 
 		 737 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  22.49 
 
 		 650 aa  55.1  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  25.1 
 
 		 652 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  22.01 
 
 		 706 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  23.61 
 
 		 650 aa  48.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  22.94 
 
 		 677 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  23.37 
 
 		 649 aa  45.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>