15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2459 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  100 
 
 		 1286 aa  2529    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1258 aa  268  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1289 aa  267  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1246 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1332 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  26.45 
 
 		 1007 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1124 aa  218  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1252 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1413 aa  194  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1358 aa  188  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1235 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1236 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1022 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1119 aa  58.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1101 aa  48.9  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>