55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0987 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  100 
 
 		 1119 aa  2224    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1101 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1203 aa  370  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1080 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1008 aa  238  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  30.96 
 
 		 656 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  29.64 
 
 		 706 aa  160  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  30.32 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  29.17 
 
 		 676 aa  147  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  29.64 
 
 		 676 aa  147  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  28.35 
 
 		 647 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  28.77 
 
 		 647 aa  138  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  28.57 
 
 		 649 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  30.73 
 
 		 650 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  32.3 
 
 		 677 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  26.92 
 
 		 692 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  28.86 
 
 		 651 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  27.89 
 
 		 650 aa  129  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  30.48 
 
 		 653 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  33.06 
 
 		 796 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  28.41 
 
 		 652 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  26.55 
 
 		 649 aa  117  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  23.87 
 
 		 785 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  26.74 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  29.44 
 
 		 503 aa  92.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  29.59 
 
 		 760 aa  91.3  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  29.37 
 
 		 503 aa  88.2  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1088 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  37.82 
 
 		 833 aa  81.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  29.89 
 
 		 469 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  38.21 
 
 		 986 aa  73.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.99 
 
 		 957 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  38.33 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1332 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1236 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1744 aa  72.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  29.52 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1183 aa  72  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  26.87 
 
 		 289 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1030 aa  70.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  29.15 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  27.8 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  26.89 
 
 		 843 aa  68.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1289 aa  65.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1235 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  30.26 
 
 		 1007 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  31.94 
 
 		 854 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1168 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1124 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1252 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  25.82 
 
 		 939 aa  59.3  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1286 aa  58.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1258 aa  56.2  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  28.39 
 
 		 374 aa  48.5  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1413 aa  44.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>