17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0673 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  33.05 
 
 
1413 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  100 
 
 
1358 aa  2748    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  33.37 
 
 
1289 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  26.81 
 
 
1258 aa  290  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  26.75 
 
 
1246 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  27.52 
 
 
1022 aa  227  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  24.94 
 
 
1124 aa  214  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  25.59 
 
 
1252 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  31.72 
 
 
1332 aa  202  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  26.41 
 
 
1007 aa  201  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.88 
 
 
1235 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  28.35 
 
 
1236 aa  191  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  27.54 
 
 
1286 aa  172  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  26.37 
 
 
653 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  25.84 
 
 
649 aa  52.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  27.59 
 
 
650 aa  47.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  23.44 
 
 
1101 aa  47  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>