21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3000 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 1413 aa  2936    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1358 aa  773    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1289 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1258 aa  315  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1246 aa  312  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1252 aa  269  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1236 aa  246  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1235 aa  246  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1022 aa  241  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  27.79 
 
 		 1007 aa  240  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1124 aa  226  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1332 aa  191  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1286 aa  190  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1101 aa  60.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1203 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  27.2 
 
 		 676 aa  52.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  24.83 
 
 		 650 aa  52.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  24.76 
 
 		 644 aa  52.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  27.2 
 
 		 676 aa  52.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  22.15 
 
 		 649 aa  50.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  22.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>