54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1666 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  93.34 
 
 		 676 aa  1296    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1368    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  42.35 
 
 		 656 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  43.79 
 
 		 644 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  42.94 
 
 		 647 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  39.91 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  41.59 
 
 		 649 aa  458  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  37.74 
 
 		 737 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  41.8 
 
 		 650 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  42.46 
 
 		 653 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  41.19 
 
 		 650 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  39.47 
 
 		 652 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  38.48 
 
 		 706 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  35.15 
 
 		 785 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  31.12 
 
 		 651 aa  220  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.03 
 
 		 677 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.45 
 
 		 692 aa  205  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1008 aa  174  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  28.97 
 
 		 649 aa  167  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1203 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1119 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1080 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  48.12 
 
 		 843 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1101 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  33.05 
 
 		 796 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  31.61 
 
 		 854 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  32.05 
 
 		 730 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  47.13 
 
 		 289 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  39.23 
 
 		 760 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  27.72 
 
 		 957 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1183 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.78 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  30.85 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.42 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.42 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.39 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1088 aa  63.9  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  32.89 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  31.58 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1168 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  38.28 
 
 		 814 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1289 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  25.35 
 
 		 423 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  26.94 
 
 		 986 aa  55.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1236 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1413 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1235 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1744 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1030 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  24.48 
 
 		 1007 aa  47.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1332 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  27.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>