23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0366 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  100 
 
 
1289 aa  2619    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  35.19 
 
 
1413 aa  498  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  33.37 
 
 
1358 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  26.7 
 
 
1258 aa  436  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  25.36 
 
 
1246 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  29.86 
 
 
1235 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  28.7 
 
 
1236 aa  277  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  28.51 
 
 
1252 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  26.1 
 
 
1124 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  28.86 
 
 
1007 aa  261  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  25.15 
 
 
1286 aa  253  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  31.69 
 
 
1332 aa  214  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  29.44 
 
 
1022 aa  192  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.17 
 
 
1203 aa  72  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.57 
 
 
1119 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  25.11 
 
 
1101 aa  59.3  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  25.29 
 
 
676 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  25.39 
 
 
676 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  27.62 
 
 
653 aa  48.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  29.02 
 
 
649 aa  46.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  23.57 
 
 
737 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  21.55 
 
 
1008 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  28.93 
 
 
647 aa  45.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>