17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3930 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 1246 aa  2590    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1289 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1258 aa  358  5e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1235 aa  320  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1413 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1236 aa  294  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1358 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1124 aa  268  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1286 aa  253  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  25.21 
 
 		 1007 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1252 aa  218  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1022 aa  197  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1332 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  24.88 
 
 		 706 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  30.85 
 
 		 650 aa  49.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1203 aa  48.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  25.88 
 
 		 677 aa  45.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>