53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0947 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  96.59 
 
 		 469 aa  931    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  955    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  97.01 
 
 		 469 aa  932    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.6 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  33.4 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  27.93 
 
 		 833 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  27.51 
 
 		 692 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  27.31 
 
 		 986 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  28.09 
 
 		 677 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  25.84 
 
 		 843 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1168 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1008 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1088 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1183 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  28.48 
 
 		 644 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 854 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  31.22 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1203 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1080 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1101 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.26 
 
 		 957 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  29.97 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  27.11 
 
 		 833 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  29.48 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1119 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1744 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  27.47 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  27.86 
 
 		 706 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  26.45 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.42 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  26.62 
 
 		 814 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  28.8 
 
 		 796 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  26.23 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  25.62 
 
 		 647 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  33.14 
 
 		 730 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  28.37 
 
 		 676 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1030 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  26.32 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  25.47 
 
 		 737 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  26.43 
 
 		 652 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  26.39 
 
 		 939 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  25.77 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  31.36 
 
 		 773 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  27.18 
 
 		 785 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1140  hypothetical protein  40.24 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1332 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  27.69 
 
 		 760 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  24.87 
 
 		 289 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  40.51 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2553  hypothetical protein  36.59 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  29.05 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  29.05 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  36.63 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>