37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1814 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  100 
 
 
814 aa  1638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  33.12 
 
 
833 aa  300  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  34.04 
 
 
1183 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  25.69 
 
 
773 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  26.8 
 
 
1168 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.22 
 
 
1008 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  30.2 
 
 
706 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  31.25 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  36.17 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.88 
 
 
469 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.37 
 
 
469 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  28.74 
 
 
650 aa  62.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.13 
 
 
469 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  27.16 
 
 
1101 aa  61.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  31.12 
 
 
986 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.67 
 
 
676 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  29.66 
 
 
676 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2553  hypothetical protein  28.06 
 
 
397 aa  58.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  28.47 
 
 
656 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  22.57 
 
 
1203 aa  57.4  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  26.71 
 
 
833 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  27.38 
 
 
649 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  27.52 
 
 
644 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  27.78 
 
 
653 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  28.74 
 
 
393 aa  54.3  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  26.88 
 
 
647 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1140  hypothetical protein  32.56 
 
 
391 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  28.93 
 
 
647 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  39.78 
 
 
957 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  27.42 
 
 
650 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  26.12 
 
 
1080 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  38.46 
 
 
651 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  38.27 
 
 
1744 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  33.71 
 
 
785 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  24.02 
 
 
737 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  26.51 
 
 
677 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  37.21 
 
 
854 aa  44.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>