27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2524 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  100 
 
 
374 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1488  hypothetical protein  44.68 
 
 
144 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.615341  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3029  phage tail protein  32.45 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  24.2 
 
 
689 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.98 
 
 
390 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  27.09 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4958  hypothetical protein  27.79 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  48.08 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  29.17 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  31.79 
 
 
647 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  22.32 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  27.01 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  27.23 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  24.72 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  31.31 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  27.84 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  27.84 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  25.94 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  32.67 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.39 
 
 
1119 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  26.02 
 
 
605 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  28.44 
 
 
854 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  28.95 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  26.24 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  25.82 
 
 
650 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  24.24 
 
 
1358 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  24.92 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>