41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4250 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  100 
 
 
376 aa  742    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  30.4 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  29.74 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  30.61 
 
 
359 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  29.52 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  30.79 
 
 
346 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  28.08 
 
 
359 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  31.14 
 
 
383 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  31.14 
 
 
383 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  28.88 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  32.73 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  30.29 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.68 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  27.24 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  30.48 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  27.24 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  27.24 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  27.6 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  31.71 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  30.06 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  34.97 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  28.89 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  32.92 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  29.79 
 
 
249 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  30.81 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  48.08 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  31.71 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  24.58 
 
 
355 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  24.58 
 
 
355 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  31.34 
 
 
378 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  31.34 
 
 
378 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  31.34 
 
 
378 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  28.65 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  28.71 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  29.91 
 
 
367 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  23.68 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  24.83 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  30.43 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  28.71 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  29.07 
 
 
651 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  26.88 
 
 
689 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>