18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1446 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  100 
 
 
363 aa  733    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  47.68 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  44.96 
 
 
359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  41.96 
 
 
359 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  35.81 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  28.99 
 
 
383 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  28.99 
 
 
383 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  29.74 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  25.96 
 
 
346 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  24.83 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  32.67 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  24.44 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  22.28 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  22.28 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  22.28 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  27.66 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  22.92 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  24.51 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>