32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0741 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  68.08 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  33.61 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  33.7 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  33.15 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  32.05 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  31.58 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  30.08 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  30.08 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  30.08 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  29.44 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  29.95 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  29.53 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  30.59 
 
 		 249 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  29.07 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  29.07 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  29.07 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  27.79 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  26.89 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  32.44 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  32.39 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  34.62 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  28.28 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  28.36 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  25 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  23.83 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  24.58 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  33.09 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  35.42 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  29.55 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  34.72 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>