35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2733 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  100 
 
 		 378 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  99.74 
 
 		 378 aa  767    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  100 
 
 		 378 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  79.63 
 
 		 378 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  58.01 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  44.33 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  41.06 
 
 		 386 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  35.45 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  34.3 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  32.98 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  32.6 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  29.66 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  31.62 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  30.99 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  30.99 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  30.99 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  28.95 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  30.75 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  30.91 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  26.6 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  29.07 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  29.07 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  26.49 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  25.45 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  28.63 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  28.8 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  31.34 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  29.03 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  30 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  30 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  30 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  28.35 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  23.85 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1121  hypothetical protein  27.71 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>