17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1813 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  100 
 
 
792 aa  1559    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  40.96 
 
 
833 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  33.58 
 
 
957 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  34.44 
 
 
1088 aa  92  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  31.55 
 
 
1030 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  36.81 
 
 
1744 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  31.92 
 
 
1168 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  31.22 
 
 
986 aa  77.4  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  24.77 
 
 
833 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  24.32 
 
 
1183 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  29.21 
 
 
651 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  34.75 
 
 
1080 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  27.33 
 
 
647 aa  55.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  27.27 
 
 
854 aa  54.3  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.43 
 
 
1008 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  25.82 
 
 
650 aa  50.8  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  26.46 
 
 
939 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>