23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1300 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  88 
 
 
400 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  100 
 
 
400 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  49.87 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  48.6 
 
 
394 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  45.41 
 
 
394 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  46.19 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  46.19 
 
 
394 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  45.94 
 
 
394 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  43.04 
 
 
390 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  43.04 
 
 
390 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  42.67 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  41.58 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.86 
 
 
384 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.95 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.75 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.04 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  42.01 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  34.62 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  37.21 
 
 
193 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  32.65 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  30.04 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  29.33 
 
 
605 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  25.4 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>