More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3523 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3523  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
321 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0138063  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
321 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.51 
 
 
321 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149642  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.04 
 
 
325 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.725204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.21 
 
 
318 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.054126  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.01 
 
 
376 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.66 
 
 
318 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.35 
 
 
314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.506454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.64 
 
 
315 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275588  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 
317 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1923  ABC transporter permease  47.63 
 
 
316 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887437  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
316 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.19 
 
 
335 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.042113  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.88 
 
 
334 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
317 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
317 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.02 
 
 
369 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00925001  normal  0.561279 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
317 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
317 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
316 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.74 
 
 
317 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
316 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 
318 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.44 
 
 
318 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.27 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.18 
 
 
316 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.570191  normal  0.169203 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5663  ABC transporter membrane spanning protein  46.77 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
318 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0156  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.77 
 
 
318 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383247  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 
323 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.758798  normal  0.425001 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
317 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.0574372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0250  peptide ABC transporter, permease protein  46.77 
 
 
318 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
318 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1496  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  48.26 
 
 
317 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592571  hitchhiker  0.00104158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
317 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0787  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  46.86 
 
 
317 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.37 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
314 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.44 
 
 
313 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
313 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
314 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.58 
 
 
313 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
313 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
315 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
314 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
313 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  37.71 
 
 
313 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654938  hitchhiker  0.00239439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
319 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
313 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
315 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
313 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.98 
 
 
316 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
309 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 
321 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
315 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
315 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
313 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.24 
 
 
308 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
315 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3714  nickel ABC transporter permease(nikB)  35.53 
 
 
315 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
313 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37 
 
 
306 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
313 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
334 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
315 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
314 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
318 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0735009  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  35.69 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
320 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.9 
 
 
315 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
305 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  39.53 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
311 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.48 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  34.88 
 
 
307 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.48 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  36.1 
 
 
306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
306 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  37.91 
 
 
316 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
311 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.153142  normal  0.0602666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>