More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2849 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 313 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.99 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  63.26 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.62 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.86 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.46 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.11 
 
 		 313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.06 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.83 
 
 		 315 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.68 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  46.59 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  45.81 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  46.11 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.27 
 
 		 341 aa  281  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  45.99 
 
 		 339 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  45.65 
 
 		 336 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  45.51 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  45.51 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  45.21 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  44.91 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  45.21 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  45.83 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  47.44 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  47.44 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  44.18 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  47.44 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  47.44 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  44.91 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  44.94 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  44.61 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  45.1 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  44.61 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  44.61 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 381 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  44.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  45.21 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  44.81 
 
 		 339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  45.21 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  43.91 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  43.62 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.21 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.45 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  43.85 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  44.55 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  44.55 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  44.01 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 334 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  44.31 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>