More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2625 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 313 aa  607  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.79 
 
 		 313 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.76 
 
 		 314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.77 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  64.86 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  60.06 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.86 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.29 
 
 		 315 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 		 314 aa  289  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.38 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  48.35 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.48 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  47.75 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  45.48 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  45.51 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  44.61 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  46.25 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  45.95 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  46.25 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  44.44 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.74 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  45.19 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  45.65 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  44.55 
 
 		 307 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 306 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.44 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  45.19 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  44.14 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  46.55 
 
 		 336 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  43.84 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  43.54 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  43.54 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.54 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  44.94 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  44.64 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  46.85 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  44.74 
 
 		 334 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  44.94 
 
 		 339 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 306 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  42.63 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  45.24 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  44.55 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  44.55 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.44 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  44.55 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  42.64 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  44.55 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.55 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  46.3 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  42.63 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.63 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  43.75 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>