More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1381 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.49 
 
 		 307 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.16 
 
 		 307 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  93.11 
 
 		 306 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.13 
 
 		 306 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.26 
 
 		 306 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.95 
 
 		 306 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.62 
 
 		 306 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.97 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.97 
 
 		 306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.64 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.31 
 
 		 306 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.3 
 
 		 306 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.3 
 
 		 306 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.3 
 
 		 306 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  79.34 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  80.66 
 
 		 306 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  79.34 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  79.34 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  79.02 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  79.02 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  80.66 
 
 		 306 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  80.66 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  81.64 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  80.66 
 
 		 327 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  79.02 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  79.02 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  80.66 
 
 		 306 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  79.02 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80 
 
 		 306 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  80.33 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  78.03 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.05 
 
 		 311 aa  497  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.66 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.33 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  80.33 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.66 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  80.33 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  80.33 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.67 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.17 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.64 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.97 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.95 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.61 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.61 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.28 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  48.68 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  48.68 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.68 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  48.84 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  48.84 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.87 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  42.17 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.43 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  41 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  42.06 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  42.51 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  41.18 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  40.51 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  41.76 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  42.31 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 381 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  41.47 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>