More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3533 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
305 aa  610  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.09 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.33 
 
 
307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
306 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
306 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  43.09 
 
 
306 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.76 
 
 
306 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  43.09 
 
 
306 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
306 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
311 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
306 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  42.43 
 
 
307 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
306 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 
307 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.76 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2185  ABC transporter, inner membrane subunit  53.16 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
308 aa  272  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.09 
 
 
306 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.43 
 
 
306 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  41.78 
 
 
306 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
306 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  41.78 
 
 
306 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  41.45 
 
 
306 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  41.45 
 
 
306 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  46.05 
 
 
306 aa  268  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  46.05 
 
 
306 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
313 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
306 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  46.05 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.05 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
306 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  44.74 
 
 
336 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
306 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  42.43 
 
 
306 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
306 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
313 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  45.95 
 
 
336 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  46.25 
 
 
336 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
312 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
306 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  45.51 
 
 
313 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
306 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
306 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  46.55 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
315 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  45.21 
 
 
337 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  42.11 
 
 
327 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  46.55 
 
 
336 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
334 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
334 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
306 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
314 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.81 
 
 
315 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 
336 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 
303 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
336 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  45.95 
 
 
336 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  44.59 
 
 
313 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  45.95 
 
 
336 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.63 
 
 
316 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  43.41 
 
 
316 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.14 
 
 
336 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
336 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
336 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.57 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  43.54 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  42.62 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  44.44 
 
 
336 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
336 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  44.44 
 
 
336 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  44.44 
 
 
336 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>