More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3044 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  97.62 
 
 		 336 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  97.32 
 
 		 336 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  96.73 
 
 		 336 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 336 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.02 
 
 		 336 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 336 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  99.7 
 
 		 336 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  91.37 
 
 		 336 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  90.48 
 
 		 336 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  90.18 
 
 		 336 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  89.02 
 
 		 337 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  89.64 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  89.64 
 
 		 338 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  89.64 
 
 		 338 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  89.64 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  90.48 
 
 		 336 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  90.77 
 
 		 336 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  90.77 
 
 		 336 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  75.3 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  75.3 
 
 		 336 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  75.3 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  75.3 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75.3 
 
 		 336 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  74.7 
 
 		 336 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  74.4 
 
 		 336 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  73.51 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  72.32 
 
 		 336 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  68.45 
 
 		 336 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.15 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  68.15 
 
 		 336 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.83 
 
 		 336 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  72.02 
 
 		 336 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  68.45 
 
 		 336 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.15 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.66 
 
 		 334 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  67.26 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  71.13 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.96 
 
 		 334 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  66.67 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  65.49 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  64.67 
 
 		 334 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  66.08 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  65.78 
 
 		 351 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  64.9 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  64.9 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  65.07 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.67 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  64.18 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  62.87 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  63.88 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.77 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.87 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  62.69 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.39 
 
 		 335 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  62.39 
 
 		 335 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  58.16 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.79 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0353588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  53.45 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.19 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.54 
 
 		 334 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.59 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 332 aa  318  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 		 333 aa  318  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  47.6 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.75 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.24 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  44.78 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.27 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.14 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 		 334 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  45.21 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.4 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.36 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>