More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0577 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  52.92 
 
 
318 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 
358 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0154408  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
317 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
317 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
317 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
325 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.725204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0156  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.21 
 
 
318 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383247  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
318 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
313 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1923  ABC transporter permease  41.69 
 
 
316 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887437  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0250  peptide ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 
318 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
316 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275588  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5663  ABC transporter membrane spanning protein  39.16 
 
 
318 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
314 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
318 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.570191  normal  0.169203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
318 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.054126  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
316 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.506454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
316 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  n/a   
 
 
 
NC_011368  Rleg2_5303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00925001  normal  0.561279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
323 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.758798  normal  0.425001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
317 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
335 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.042113  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
320 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
334 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236346 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
317 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.0574372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0787  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.4 
 
 
317 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
318 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.07 
 
 
308 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
315 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
317 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3523  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.26 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0138063  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1496  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
317 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592571  hitchhiker  0.00104158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
306 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149642  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
314 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.66 
 
 
316 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
336 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654938  hitchhiker  0.00239439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
315 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
313 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.76 
 
 
305 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
313 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
306 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.01 
 
 
306 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
335 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
305 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
318 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
315 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
306 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
306 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
306 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
314 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
318 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
306 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
305 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
305 aa  192  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
306 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  35.92 
 
 
307 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
315 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
306 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
311 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 
314 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
306 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.16 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
306 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
313 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
313 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.85 
 
 
314 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
313 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
315 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.29 
 
 
315 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0789  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, innermembrane subunit  40.26 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445357  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
315 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>