More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6476 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  100 
 
 
316 aa  617  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.75 
 
 
355 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.81 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.73 
 
 
316 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.12 
 
 
320 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742019  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.75 
 
 
320 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.75 
 
 
336 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.1 
 
 
318 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.63 
 
 
315 aa  362  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  54.81 
 
 
316 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
313 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.41 
 
 
335 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.6 
 
 
315 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.56 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1011  peptide ABC transporter, permease protein  54.81 
 
 
317 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0953  peptide ABC transporter, permease protein  54.81 
 
 
317 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.85 
 
 
315 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
334 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
308 aa  245  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  41.35 
 
 
314 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
315 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
315 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.91 
 
 
315 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.133391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
320 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
313 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
315 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
306 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
334 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
306 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
313 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
320 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
320 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
314 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  39.17 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  39.17 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 
333 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
324 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
306 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.45 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  39.17 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.42 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
313 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
334 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
316 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.42 
 
 
306 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
302 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
315 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
306 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
306 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.46 
 
 
337 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.1 
 
 
306 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  41.1 
 
 
306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  41.1 
 
 
306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
313 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  41.1 
 
 
306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  42.72 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
313 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
313 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
315 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  42.12 
 
 
327 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
313 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
311 aa  227  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
315 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.78 
 
 
315 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
319 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
308 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  38.83 
 
 
313 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
313 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
306 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
306 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.39 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.13 
 
 
313 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
319 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 
306 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
306 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 
306 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 
306 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 
306 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
306 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>