More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2794 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  594  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.76 
 
 
315 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
306 aa  258  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
313 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
313 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  43.67 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
314 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
308 aa  245  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  44.09 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  43.86 
 
 
306 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  43.86 
 
 
306 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  43.86 
 
 
306 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.86 
 
 
306 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.86 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
315 aa  242  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
315 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
334 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.93 
 
 
315 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.63 
 
 
313 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.75 
 
 
313 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
335 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
312 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
313 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 
316 aa  231  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
324 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
313 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
334 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
313 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.41 
 
 
314 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
313 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.88 
 
 
313 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
334 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  39.64 
 
 
339 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
319 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
302 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
313 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
308 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
313 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
315 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
314 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
381 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  41.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
316 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.53 
 
 
315 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.38 
 
 
313 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.36 
 
 
308 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.46 
 
 
325 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  40.83 
 
 
339 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  42.19 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
334 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
320 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
313 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
313 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.24 
 
 
359 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
313 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
326 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
315 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
315 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  39.05 
 
 
351 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
315 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
320 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
306 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1011  peptide ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0953  peptide ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  40.25 
 
 
318 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
306 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
320 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742019  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
313 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>