More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1187 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1187  transaldolase B  100 
 
 		 313 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.520683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1203  transaldolase B  98.08 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  73.4 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000493372  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  50.63 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  50.48 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  50.63 
 
 		 334 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  51.97 
 
 		 332 aa  315  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  48.73 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  49.69 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  50 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  49.69 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  48.77 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  47.34 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  50 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  47.9 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  49.52 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  48.56 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  47.32 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  49.52 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  47.32 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  48.84 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  50.64 
 
 		 317 aa  291  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  48.26 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  291  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  47.32 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  48.88 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  50.83 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  49.22 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05451  transaldolase B  46.93 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  48.88 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  48.89 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  48.89 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  48.89 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  48.73 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  50.33 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  47.6 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  49.51 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  48.56 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  49.05 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  48.59 
 
 		 318 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  49.05 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  49.05 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  49.05 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  48.1 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  47.88 
 
 		 310 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  49.05 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  47.63 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  47.17 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  47.94 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  48.73 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  45.95 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  49.19 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  47.47 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  46.3 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  47.44 
 
 		 318 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  49.67 
 
 		 321 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  48.34 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  48.7 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  46.69 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  47.78 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  46.23 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  47.76 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  48.74 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  47.3 
 
 		 318 aa  278  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  48.34 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  47.08 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  47.76 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  46.75 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  47.28 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  46.75 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  47.13 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  48.24 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  45.89 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  47.04 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  47.94 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  45.74 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  45.86 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  48.42 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  46.86 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  47.16 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  47.13 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  48.73 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  45.74 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>