More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1231 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  100 
 
 		 319 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  92.79 
 
 		 319 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  92.79 
 
 		 319 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  75 
 
 		 318 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  74.68 
 
 		 318 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2374  transaldolase B  71.75 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  71.11 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2254  transaldolase B  71.11 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  72.06 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0942  transaldolase B  71.43 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0291755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  72.06 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  72.7 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  72.06 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  71.75 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2335  transaldolase B  71.75 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1166  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  72.06 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1326  transaldolase B  72.38 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  71.11 
 
 		 317 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  68.91 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  68.59 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  66.99 
 
 		 317 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  67.63 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  66.67 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  66.03 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  64.74 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  64.65 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  65.81 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1779  transaldolase B  66.03 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  66.35 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1265  transaldolase B  64.56 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.785654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0685  transaldolase B  64.54 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.947987  normal  0.786497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  65.06 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  61.66 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  59.94 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  62.06 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  59.75 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  60.45 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  61.41 
 
 		 308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  62.06 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  62.06 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  59.31 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  60.83 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  61.74 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  59.12 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  58.18 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  58.81 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  58.41 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  58.84 
 
 		 309 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  56.01 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  57.78 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.66 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  58.41 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  58.13 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  58.41 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  57.46 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  57.37 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  57.37 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  57.46 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  57.46 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  57.37 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  57.68 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.39 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.39 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  56.29 
 
 		 334 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  61.04 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  56.92 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  56.43 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  56.52 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  57.63 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  57.46 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  57.67 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  57.01 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  62.38 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  56.43 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  56.83 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  56.43 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  56.43 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  56.43 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  56.43 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  56.43 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  56.83 
 
 		 318 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  56.43 
 
 		 317 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  57.32 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  56.83 
 
 		 318 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  56.43 
 
 		 317 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  56.43 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  56.6 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  56.83 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>