More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1851 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  98.49 
 
 		 332 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  100 
 
 		 332 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  73.19 
 
 		 390 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  73.49 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  73.49 
 
 		 390 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  73.54 
 
 		 339 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  64.46 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  65.54 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  65.54 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  64.63 
 
 		 334 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  64.67 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  63.41 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  63.25 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  64.92 
 
 		 332 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  65.06 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  62.5 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05451  transaldolase B  62.58 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514007  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  62.26 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  58.93 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  59.19 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  58.88 
 
 		 319 aa  360  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  58.36 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  56.11 
 
 		 321 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  57.32 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  56.92 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  56.07 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  57.94 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  57.72 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  56.07 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  56.07 
 
 		 317 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  56.79 
 
 		 316 aa  345  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  56.13 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  55.76 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  54.43 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  55.73 
 
 		 316 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  55.14 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  55.14 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  55.14 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  55.45 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  55.14 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  55.14 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  55.14 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  55.14 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  55.14 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  54.52 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  55.14 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  54.94 
 
 		 317 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  56.39 
 
 		 318 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  56.7 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  56.56 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  56.07 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  56.17 
 
 		 308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  56.07 
 
 		 318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  56.52 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  56.39 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  56.17 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  55.76 
 
 		 318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  56.07 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  56.07 
 
 		 317 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  55.31 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  55.45 
 
 		 318 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  55.45 
 
 		 318 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  55.45 
 
 		 318 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  55.14 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  55.76 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  54.66 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  55.59 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  56.07 
 
 		 308 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  55.1 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  54.89 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  53.12 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  54.89 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  54.43 
 
 		 319 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  54.83 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  54.21 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  53.58 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  52.92 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  53.58 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  52.92 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  53.87 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  55.17 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  50.93 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  53.07 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  54.8 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  54.02 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74289  transaldolase  56.21 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.318947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  52.94 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  54.61 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  53.42 
 
 		 313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  55.14 
 
 		 308 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  50.78 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2361  transaldolase B  53.75 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  53.27 
 
 		 308 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>