More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1075 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  100 
 
 
319 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  98.75 
 
 
319 aa  646    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  92.79 
 
 
319 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  76.68 
 
 
318 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  73.73 
 
 
318 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  72.7 
 
 
317 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  71.75 
 
 
317 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  73.02 
 
 
317 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0942  transaldolase B  71.11 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0291755  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1326  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  72.38 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1166  transaldolase B  71.43 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2254  transaldolase B  69.84 
 
 
317 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.333089  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  70.16 
 
 
317 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2374  transaldolase B  70.48 
 
 
317 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2335  transaldolase B  70.16 
 
 
317 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  70.48 
 
 
317 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  70.48 
 
 
317 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  66.77 
 
 
316 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  67.09 
 
 
316 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  67.3 
 
 
315 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  66.67 
 
 
315 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  64.01 
 
 
318 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  64.01 
 
 
316 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  65.18 
 
 
317 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  64.44 
 
 
315 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1265  transaldolase B  66.35 
 
 
339 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.785654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1779  transaldolase B  65.08 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  64.42 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  65.38 
 
 
315 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0685  transaldolase B  64.86 
 
 
322 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.947987  normal  0.786497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  62.18 
 
 
320 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  63.41 
 
 
315 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  61.54 
 
 
310 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  59.43 
 
 
313 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  59.81 
 
 
309 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.62 
 
 
397 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  62.06 
 
 
308 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  58.99 
 
 
317 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  60.12 
 
 
316 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  62.38 
 
 
308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  61.74 
 
 
308 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  62.06 
 
 
308 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  56.78 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  57.28 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  60.77 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  57.59 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  57.23 
 
 
334 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.35 
 
 
392 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  62.82 
 
 
308 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.55 
 
 
390 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  58.31 
 
 
317 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  61.04 
 
 
307 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  56.96 
 
 
318 aa  352  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  57.86 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.21 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.21 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  56.96 
 
 
318 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  57.37 
 
 
317 aa  351  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  56.96 
 
 
318 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  58.31 
 
 
317 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  56.11 
 
 
319 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  58.31 
 
 
317 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  58.31 
 
 
317 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  56.74 
 
 
316 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  58.57 
 
 
317 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  57.68 
 
 
317 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  57.68 
 
 
317 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  57.68 
 
 
317 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  57.68 
 
 
317 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  57.68 
 
 
338 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  57.68 
 
 
317 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  57.68 
 
 
317 aa  348  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  57.68 
 
 
317 aa  348  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  57.68 
 
 
338 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  56.29 
 
 
316 aa  348  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  57.37 
 
 
318 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  61.09 
 
 
308 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  56.78 
 
 
316 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  56.43 
 
 
316 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  57.19 
 
 
316 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  58.26 
 
 
317 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  56.74 
 
 
316 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  56.51 
 
 
318 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  56.51 
 
 
318 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  57.05 
 
 
317 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  56.51 
 
 
318 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  57.05 
 
 
317 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>