More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1054 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1056    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  85.29 
 
 		 510 aa  898    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  97.47 
 
 		 514 aa  1005    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 500 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 500 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 500 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 500 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 500 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 499 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  61.92 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 502 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02769  lysyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 522 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.696158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1361  lysyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  58.55 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0195  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00927236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  59.76 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0827  lysyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81959  normal  0.0384226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3196  lysyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0568381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3296  lysyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0992  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  57.71 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  57.71 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3049  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0940  lysyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 501 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0434875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4082  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0178605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3614  lysyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.659377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0873  lysyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3419  lysyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.535831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3491  lysyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0812  lysyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3127  lysyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.578616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2270  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004437  lysyl-tRNA synthetase (class II)  58.23 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  57.83 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0841  lysyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 500 aa  571  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0757  lysyl-tRNA synthetase  57.57 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.527071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  56.32 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  56.32 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 499 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0583  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00960  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0566  lysyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 508 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 502 aa  558  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 505 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 512 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2877  lysyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>