More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0893 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 520 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  71.28 
 
 		 513 aa  730    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 510 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 		 514 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  62.32 
 
 		 496 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  62.32 
 
 		 496 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 501 aa  698    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  65.05 
 
 		 516 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  100 
 
 		 501 aa  1031    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 514 aa  668    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  66.07 
 
 		 508 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 524 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 504 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 515 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  68.92 
 
 		 507 aa  717    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 508 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  66.34 
 
 		 509 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 516 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 513 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 		 514 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  66.54 
 
 		 515 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 508 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 508 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 512 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  66.07 
 
 		 508 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 508 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 508 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 514 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 518 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 		 519 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 518 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 515 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 496 aa  631  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 511 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 		 508 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 503 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3052  lysyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 527 aa  624  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 499 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3050  lysyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 521 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  60.98 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 505 aa  614  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  60.98 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1784  lysyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 520 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 505 aa  614  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 505 aa  614  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 496 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 500 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 499 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 500 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 500 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 506 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 501 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 506 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  58.2 
 
 		 502 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 495 aa  591  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>