More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4226 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  99.8 
 
 		 500 aa  1026    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  88.32 
 
 		 505 aa  915    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 496 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  99.8 
 
 		 500 aa  1026    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  89.42 
 
 		 501 aa  924    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  93.2 
 
 		 500 aa  961    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 505 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  65.12 
 
 		 511 aa  670    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  93 
 
 		 500 aa  960    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 499 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 505 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  93.84 
 
 		 499 aa  947    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 505 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  67.94 
 
 		 500 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 505 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  66.6 
 
 		 502 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  86.37 
 
 		 500 aa  897    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 502 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1028    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 		 510 aa  641    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  89.82 
 
 		 501 aa  929    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 505 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  98.6 
 
 		 500 aa  1016    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2270  lysyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 511 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 499 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  61.63 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 514 aa  628  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 		 505 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  63.21 
 
 		 514 aa  629  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  61.63 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 504 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 509 aa  626  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 496 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02769  lysyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 522 aa  621  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.696158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1361  lysyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 517 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0195  lysyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00927236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4082  lysyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 524 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0178605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0841  lysyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3127  lysyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.578616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0827  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81959  normal  0.0384226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3196  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0568381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3296  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 513 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3049  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 500 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00960  lysyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0992  lysyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  60.45 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  60.45 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3491  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  60.49 
 
 		 501 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0940  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 501 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0873  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3614  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.659377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0583  lysyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2877  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3419  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.535831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0812  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0757  lysyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 		 501 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.527071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004437  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.22 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 516 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 524 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 508 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0566  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>