117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0396 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0396  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 		 332 aa  682    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  37.89 
 
 		 351 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  37.78 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  33.12 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  30.12 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  31.06 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  31.19 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  33.44 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  31.78 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  33.11 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  31.68 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  29.6 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  30.86 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  31.08 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  32.82 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  32.79 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  32.79 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  31.08 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  31.87 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  31.68 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  29.1 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  30.75 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  32.35 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  32.35 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  29.1 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  32.46 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  32.46 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  30.25 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  29.94 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  29.74 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  30.53 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  30.25 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  29.38 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  30.6 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  32 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  30.12 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  29.91 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  30.28 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  30.28 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  30.28 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  30.28 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.84 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  29.05 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  32.2 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  30.1 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.83 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.97 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  29.91 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  28.8 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  27.5 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  27.59 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  26.79 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25.3 
 
 		 392 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  24.76 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  25.24 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  24.15 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.08 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  24.61 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.16 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  25.31 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  24.22 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  24.22 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  23.91 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.82 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  26.23 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  22.67 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  24.21 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.9 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  25.55 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  22.88 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  24.75 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  22.11 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  37.96 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  23.36 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  24.43 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  21.98 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  23.77 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  21.94 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  23.82 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  22.74 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  21.3 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  33.03 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  33.03 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.67 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.04 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  33.33 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>