More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1257 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  100 
 
 		 348 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  51.68 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  43.84 
 
 		 343 aa  255  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.41 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  41.26 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  43.03 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  40.57 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  41.22 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  39.56 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  39.86 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  39.33 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  37.61 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  37.54 
 
 		 360 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  40.5 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  43.25 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  36.68 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  37.94 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.62 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  35.29 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.24 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  40.74 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  34.18 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  34.07 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.3 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.41 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.36 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  34.32 
 
 		 335 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.74 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.25 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.05 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.03 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  33.96 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  33.44 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  33.44 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  34.29 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  33.44 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.86 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  35.84 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  35.62 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.17 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  32.31 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  32.31 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  32.31 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  32.84 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  29.33 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  34.17 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.96 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  35.93 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  37.46 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.49 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  32.18 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  30.34 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  34.02 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  30.56 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  35.33 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  29.34 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  33.97 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.41 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  32.92 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.27 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.33 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  34.88 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  33.98 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  31.76 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  32.94 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  32.38 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  34.71 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  34.52 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  33.12 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  31.8 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  32.54 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.2 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  34.07 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1431  transport system permease protein  32.98 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.05 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  33.76 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  35.35 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  34.43 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  34.04 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  31.85 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.13 
 
 		 389 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  31.33 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  32.8 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  31.85 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  32.98 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  31.8 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  34.85 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  31.76 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  33.45 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  32.27 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  35.49 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  32.24 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  33.22 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  32.27 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>