More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0343 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  670    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  72.31 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  61.25 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  57.41 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  45.13 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  49.42 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  46.73 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  43.96 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  47.06 
 
 		 364 aa  265  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  46.18 
 
 		 340 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  43.34 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  41.36 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  52.81 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  42.31 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  41.22 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.72 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  30.06 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  43.63 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  30.75 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  35.51 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  34.47 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  35.09 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  33.24 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  34.94 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.2 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  34.3 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  34.84 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.56 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.86 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  35.13 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  34.84 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  34.84 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  34.56 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  30.9 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.09 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  36.84 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  33.14 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  29.49 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  30.17 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  34.38 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.62 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  39.26 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  31.2 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  32.87 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  36.78 
 
 		 429 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  32.1 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  36.67 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.62 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  33.72 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  32.72 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  30.9 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  36.96 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.09 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  37.07 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.99 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  31.27 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  35.95 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  32 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  32.66 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  34.23 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.6 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  34.05 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  32.84 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  31.46 
 
 		 344 aa  150  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  32.34 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  35.94 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  32.38 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  36.72 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  35.52 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  35.78 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.14 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  36.65 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  37.92 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  35.49 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  30.53 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.3 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  29.7 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  37.18 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  29.39 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  36.31 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  33.72 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  34.21 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  32.43 
 
 		 357 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  34.56 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  32.54 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  36.18 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  32.23 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  33.54 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.98 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  34.73 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  27.09 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  32.82 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  31.69 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  31.97 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  32.56 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>