More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2111 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  100 
 
 		 391 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  45.37 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  42.01 
 
 		 340 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  46.32 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  43.83 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  42.01 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  41.08 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  43.08 
 
 		 322 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  42.04 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  39.38 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  42.82 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  43.45 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  44.9 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  41.56 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  43.77 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  38.1 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  34.49 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  40.18 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  31.67 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  32.76 
 
 		 349 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  30.79 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.43 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0113  transport system permease protein  32.56 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  35.37 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.33 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.53 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.35 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  33.14 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  32.27 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  34.02 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  33.89 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  33.89 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  33.89 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.82 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.45 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  35.45 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  31.78 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  29.82 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  33.91 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  33.78 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  34.38 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.38 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  32.24 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.84 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  30.92 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  29.57 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  34.59 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  35.73 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.01 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.22 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  35.79 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0129  transport system permease protein  33.12 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0463591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  34.86 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  32.42 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  36.58 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  31.65 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.61 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.29 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  31.82 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.73 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  30.64 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  32.71 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  34.19 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.95 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.19 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  29.84 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  35 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  35.34 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  32.76 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  31.94 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.19 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  33.11 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  33.55 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  31.63 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  33.98 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  30.49 
 
 		 333 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  35.05 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  34.9 
 
 		 334 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  36.93 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  36.93 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  36.93 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  36.93 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  29.88 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  37.41 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  38.3 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  36.93 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  31.07 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  33.02 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  30.57 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  31.44 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.47 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  36.58 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  33.23 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  31.08 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  34.02 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  31.87 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  33.05 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>