More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0575 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  100 
 
 
357 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  75.92 
 
 
353 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  75.92 
 
 
360 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  75.92 
 
 
360 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  75.84 
 
 
360 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  78.32 
 
 
360 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  78.06 
 
 
360 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  79.14 
 
 
360 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  78.32 
 
 
360 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  68.71 
 
 
359 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  69.01 
 
 
359 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  69.01 
 
 
359 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  69.01 
 
 
359 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  68.42 
 
 
359 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  62.54 
 
 
371 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  64.63 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  55.25 
 
 
360 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  52.42 
 
 
365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  55.52 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  51.31 
 
 
356 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  51.04 
 
 
347 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  51.02 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  50.74 
 
 
360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  50.3 
 
 
355 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  51.6 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  58.06 
 
 
344 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  49.85 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 
352 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  58.08 
 
 
353 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  48.11 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  46.9 
 
 
354 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  43.75 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  46.27 
 
 
347 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  50.9 
 
 
343 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  42.61 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  46.75 
 
 
354 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  45.91 
 
 
319 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  46.04 
 
 
350 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.92 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  40.62 
 
 
367 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.15 
 
 
362 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.31 
 
 
373 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.46 
 
 
383 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.51 
 
 
357 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  38.66 
 
 
374 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.56 
 
 
369 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.08 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  38.81 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  39.41 
 
 
352 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  39.41 
 
 
352 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  34.2 
 
 
355 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  36.97 
 
 
360 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  44.06 
 
 
301 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.09 
 
 
362 aa  209  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.53 
 
 
348 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.81 
 
 
375 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.94 
 
 
348 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.64 
 
 
357 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  33.53 
 
 
348 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.73 
 
 
340 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  37.54 
 
 
359 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  37.2 
 
 
344 aa  202  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.73 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  35.08 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  37.9 
 
 
356 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.38 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  37.93 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  33.43 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.72 
 
 
349 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
336 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.5 
 
 
361 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  35.62 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  37.72 
 
 
361 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  35.61 
 
 
350 aa  182  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.9 
 
 
341 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.66 
 
 
334 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.66 
 
 
334 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.75 
 
 
319 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.66 
 
 
334 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.63 
 
 
347 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.74 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  39.74 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.57 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.14 
 
 
330 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.91 
 
 
370 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.01 
 
 
347 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.59 
 
 
346 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.85 
 
 
332 aa  175  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  36.89 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  37.5 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  37.58 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  36.44 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.76 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.91 
 
 
336 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.08 
 
 
334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  35.52 
 
 
330 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.49 
 
 
315 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>