More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3058 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 346 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  47.77 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  50 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  49.71 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  47.03 
 
 		 370 aa  315  8e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  48.82 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  48.45 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  50.14 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  46.91 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  45.79 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  45.91 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  46.4 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  43.64 
 
 		 357 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  47.09 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  48.62 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  41.59 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.5 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  42.01 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  44.7 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  43.06 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  44.1 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  41.76 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  42.66 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  42.49 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.64 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.15 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  45.78 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 		 373 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  38.61 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.27 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.12 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.99 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  37.76 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.53 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.61 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.71 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  36.59 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.99 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  35.69 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.75 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  39.71 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  39.44 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  41.61 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  40.77 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  38.62 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  35.83 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  38.04 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.11 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.15 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  37.42 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  36.59 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  41.7 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  38.11 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  36.83 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.41 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.79 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  36.53 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.03 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.94 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.2 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.41 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.72 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  35.69 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.96 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  33.44 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  35.17 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  34.72 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  30.93 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  30.93 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.35 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  33.33 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.72 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  37.87 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  36.43 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.85 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  33.24 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.5 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  36.47 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  35.59 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  36.05 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  36.23 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  33.87 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  38.43 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  36.4 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  37.5 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  36.33 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.57 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  35.82 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  35.82 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  38.11 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.18 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  36.67 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  35.92 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  35.82 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  34.85 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  35.02 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>